Коммерческое производство биоэтанола второго поколения тормозится из-за проблем с финансированием, несмотря на готовность технологий. Научная основа для этого вида топлива уже создана, сырьевая база доступна, а политическая поддержка отрасли усиливается. Основная сложность заключается в переходе от лабораторных успехов к промышленным масштабам.
Главным препятствием для роста стало несоответствие между скоростью технологического прогресса и возможностями существующих финансовых структур. Инвестиционные механизмы не рассчитаны на поддержку быстрого масштабирования производства. В результате прогресс замедляется, а наибольшие барьеры возникают для небольших инновационных компаний, которым сложно получить подтверждение своих разработок и привлечь средства.
Биоэтанол второго поколения производят из отходов сельского и лесного хозяйства, в отличие от топлива первого поколения, для которого используют пищевые культуры – кукурузу и сахарный тростник. Такой подход более устойчив, но требует более сложных технологических решений.